将以上已经使用过的器具或材料在灭菌后，应在无菌箱或无菌设备内进行无菌操作。以上各种灭菌方法，主要用于的调配、充填、密封等工艺性的操作，操作速度要快。21世纪科技300-600Mpa超高压灭菌，国际公认的是该技术应用设备价格昂贵，中国主要靠进口，造成了超高压技术的应用瓶颈。国内少有几家企业在开始生产超高压设备，预计2012年可打破进口价格昂贵的应用瓶颈。
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臭氧作水的消毒时，温度越高，越有利于臭氧的分解，故杀菌效果越差加湿有利于臭氧的杀菌作用、要求湿度>60%，湿度越大杀菌效果越好。臭氧对人体呼吸道粘膜有刺激，空气中臭氧浓度达1mg/L时，即可嗅出，达2.5-5mg/L时，可引起脉搏加速、疲倦，人若停留1小时以上，可发生，以致。故在无人条件下进行消毒，消毒后停30-50分钟进入便无影响。消毒后30-60分钟臭氧自行分解为氧气，其分解时间内仍有杀菌功效，故消毒后，若房间密闭仍可保持30-60分钟。臭氧可与食品直接接触，用于食品消毒、保鲜，对食品不产生残余污染，不影响营养成份。高浓度的臭氧可以老化橡胶，使铜片锈蚀，锅炉改造用灭菌设备价格，但臭氧作空气消毒时，并非使用纯臭氧，又具有极易分解的特点，况且一般为间断使用，故不易产生对环境设备的损害。同时臭氧还可以除异味，净化环境，使空气清新。
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间歇灭菌连续3天，每天进行一次蒸气灭菌的方法。此法适用于不能耐100℃以上温度的物质和一些糖类或蛋白质类物质。一般是在正常大气压下用蒸气灭菌1小时。灭菌温度不超过100℃，不致造成糖类等物质的破坏，而可将间歇培养期间萌发的孢子，从而达到彻底灭菌的目的。
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